Wordpressの編集画面で2.9のアップデートがあったのですが、MySQL4に設定していたのでインストールできず。
いつかやろうと思っていたMySQLのバージョンアップをしてみました。
自分が行った手順は

FTPアプリで全てのファイルをローカルに保存(念のため)
phpMyadmin

• WordPressのDBを選択し、エクスポートタブをクリック


• 「DROP TABLE を追加(画像はMySQL5)」「ファイルに保存」にチェックを入れ、実行

Server Panel

MySQL設定

• MySQLユーザの一覧から指定のユーザを削除
• MySQLの一覧からデータベースを削除

MySQL Ver.切替

• MySQL5に切替え！

MySQL設定

• MySQLユーザの一覧からユーザを作成
• MySQLの追加からデータベースを作成(EUC-JP)
• MySQLの一覧でDBのアクセス権をユーザに持たせる

phpMyadmin

• MySQL の接続照合順序で「utf8_general_ci」を選択


• WordPressのDBを選択し、インポートタブをクリック
• エクスポートしたsqlファイルを選択し、実行

wp-config.php

• define(‘DB_USER’, ‘hoge’);[31行目]、define(‘DB_PASSWORD’, ‘hoge’);[35行目]にServer Panelのユーザ名とパスワード書換え
• define(‘DB_HOST’, ‘hoge’);[38行目]phpMyadminのトップページに記載されている「mysql**.xserver.jp」を記入

だったようなー。試行錯誤しながらやってみたので、必要のないまたは間違ったやり方で行っている手順もあるかと思います。
やはりファイルのエクスポート、インポートの際に、エンコードに気をつけて行う必要があります。
GUI様様ですね、これで晴れてversion2.9にアップデートできましたー。

Xserver